Ona je preminula u 84. godini života. Lečila se na Vojno-medicinskoj akademiji u Beogradu.
Od 2013. godine je, zbog teškog zdravstvenog stanja, bila smeštena u privatnom Domu za stara lica u Jajincima, a od 2004. godine bila je pod danonoćnom policijskom zaštitom.
Do 2013. je živela u selu Prekopuce kod Prokuplja.
Mila Đinđić je govorila da se prava istina o ubistvu njenog sina nikada neće saznati. Podnela je Specijalnom tužilaštvu za organizovani kriminal krivičnu prijavu protiv Nebojše Čovića i Velimira Ilića, pod sumnjom da su znali za plan Milorada Ulemeka da se izvrši atentat na Zorana Đinđića.