Iz njegovog života je do danas i sačuvana priča o tome da je u hrišćansku veru uspešno preveo ceo jedan grad - Želino u današnjoj Makedoniji.
U vreme progona hrišćana pod carem Maksimijanom, Sveti Agatonik je, zajedno sa ostalim hrišćanima, uhapšen je i odveden u Vizantiju. Nakon mučenja svima su odrubljene glave pred carem Maksimijanom.
U Carigradu je kasnije podignut hram posvećen Svetom Agatoniku. Ovog sveca kao zaštitnika slavi jedan broj porodica u Srbiji, pa je danas njima krsna slava.
Dan Svetog Agatonika pada u doba Međudnevice, kako narod naziva vreme između Male i Velike Gospojine. Od davnina se u ovom periodu po celoj Srbiji održavaju vašari i narodni sabori, pa se oni tradicionalno organizuju i na današnji dan.
Narod kaže da se danas "valja" trgovati, pa se i po vašarima okupi veliki broj kupaca i prodavaca sa raznom robom. Veruje se da je ovo vreme za susrete i obnovu prijateljstva kako bi svi u miru i blagostanju ušli u zimu.