Program obuhvata dijagnostiku,terapiju, fizičku aktivnost, pravilnu ishranu i edukaciju pacijenata. Program traje 10 dana i finansiran je od strane Republičkog fonda za zdravstveno osiguranje. Pravo na njega imaju svi oboleli od šečerne bolesti, na insulinskoj terapiji, jednom u četiri godine.
Specijalna bolnica za rehabilitaciju "Junaković" Apatin, koja raspolaže sa 140 postelja, pruža usluge medicinske rehabilitacije osobama obolelim od neuroloških, reumatskih i ortopedskih oboljenja.
Rehabilitacije se zasnivaju na individualnom pristupu svakom pacijentu, sve u odnosu na dijagnozu, kliničku sliku, želje i potrebe pojedinca. Pacijentima je na raspolaganju hidroterapija, kinezi i radna terapija, elektroterapija, termoterapija i terapijamineralnim blatom.
Hidroterapija predstavlja tretman korišćenja termo-mineralne vode u terapeutske svrhe, koja blagotvorno i izrazito pozitivno deluje na koštano-mišićni sastav. Zbog svojih specifičnosti mineralna voda može da se koristi i kao pomoćno lekovito sredstvo u vidu inhalacije kod hroničnih obstruktivnih bolesti pluća, kao i kod lečenja ginekoloških oboljenja kod žena i bračnog steriliteta.
Termomineralna voda iz izvora Banje Junaković, spada među natrijum hloridno-hidrokarbonatne i slabo sumporovite vode. Ovakve vode se sreću na teritoriji Srbije i imaju dugu tradiciju primene u balneološkoj praksi. Voda sadrži malo CO2 u gasovitom stanju, tako da se ne može svrstati u ugljeno kisele vode. Izmerena granična vrednost sulfida (0.9mg na 1 litar vode) ima balneološki značaj, te ovu vodu svrstava u kategoriju sulfidnih i mogu joj se pripisati indikacije sulfidnih voda.
Temperatura vode u bazenu i kadama je 35 stepeni celzijusa.
Vode Banje Junaković potiču sa dubine od 700 m i dostižu temperaturu od 50ºC. Po svom kvalitetu spadaju u isti red kao i one u Karlovim Varima, Harkanju i Lipiku.
Kombinacija hidroterapije i grupnih ili individualnih vežbi u terapijskom bazenu.